Dalam menjalankan kegiatan belajar-mengajarnya, SMK Malaka memiliki visi dan misi yang menjadi acuan kerja sebagai berikut.
Visi
Mewujudkan SMK Malaka menjadi SMK kelompok Teknologi Industri yang terbaik di wilayah DKI Jakarta berdasarkan Iman dan Taqwa.
Misi
- Meningkatkan Iman dan Taqwa serta akhlak yang mulia dan berbudi pekerti luhur.
- Meningkatkan Mutu dan Relevansi pendidikan sesuai dengan kurikulum terbaru.
- Meningkatkan mutu tamatan dengan Efektivitas dan Efisiensi.
- Meningkatkan prosentasi penyerapan lulusan di dunia industri dengan memperluas kerjasama dengan Dunia Usaha dan Dunia Industri.